羊近亲交配易造成“两降一高”的弊病，即：羊只生产性能下降，品种退化，生产发育迟缓，产肉产毛量降低50%左右；繁殖率下降，怪胎、流产、化胎、死胎不断出现；羊只抗病力差，死亡率高。这一问题必须引起养羊专业户重视，主要应对办法有三条：
　　
　　一、调换种公羊。在一个羊群中种公羊连续使用两年后，应与其它羊群中同一品种的种公羊进行调换。降低近亲交配次数。 
　　
　　二、种公羊单独饲养。到配种季节，选择血缘关系远的种公羊进行人工辅助配种或人工授精。采用这种方法不仅可避免近亲繁殖，而且可以控制母羊产羔时间，延长种公羊利用年限。 
　　
　　三、在羊数量集中的乡、村，应建立羊只人工授精站。授精站应建立档案制度，包括种公、母羊卡片、母羊繁殖登记表，羔羊登记表及后代测定记录表等。有了这一档案，血缘关系就清楚了，就可以有计划地选种选配，避免近亲繁殖。