实验动物按遗传学可分为相同基因类型和不同基因类型两大类。相同基因类型又分为近交系、突变系和杂交F1代；不同基因类型又称远交群或封闭群。
一、实验动物品种、品系的概念
1. 种 种(species)是生物学分类的最基本单位。在实验动物学中，种是指有繁殖后代能力的同一种类的动物。而有生殖隔离的动物则是异种动物。
2. 品种 种以下还可有进一步小的分类，如品种(stock)。品种一般系指具有一些容易识别和人们所需要的性状，而且可以基本稳定的遗传的动物群体。如新西兰白兔、青紫兰兔、Wistar大鼠、KM小鼠等。
3. 品系 在实验动物学中把基因高度纯合的动物称作品系(strain)动物。 例如，C57BL/6是近交系动物中的一个品系，属低癌组、高补体活性的动物。 又如，肌萎缩症(dystrophia muscularis)小鼠是带有突变基因(dy/dy)的品系动物。
4. 杂交系 两个近交品系动物之间有计划交配，获得的第一代动物， 称之为杂交系(hybrid strain)或杂交一代动物，简称F1动物。
二、作为品系、品种的条件
作为一个品系或品种，应具备以下条件：
(一)相似的外貌特征：例如小鼠C57BL/6品系的毛色是黑色的,DBA/2 品系的毛色是灰色的,KM品种的毛色是白色的。当然,相似的外貌特征只是品系、品种应具备的条件之一。不同品系、品种的动物也有外貌相似的,例如A、KM等十几个，品种、品系动物的毛色都是白色，但它们在其他的条件上是有区别的。
(二)独特的生物学特性：独特的生物学特性是一个品系、品种存在的基础。在长期的研究过程中，科学工作者在一些动物身上发现了所需要的不同于其他动物的生物学特性，进行定向选择，将这些特性保留下来，成为今天为数众多的品系、品种。就白化小鼠而言多达几十种，但每个品系、品种的生物学特性都有或多或少的差别。例如A品系,在经产鼠中高发乳腺肿瘤，对致癌物质敏感，易产生肺癌，老年鼠多有肾脏病变； AKR品系自发淋巴细胞白血病；ICR品种繁殖能力强。
(三)稳定的遗传性能：作为一个品系，不仅要有相似的外貌特征，独特的生物学特性，更重要的是要有稳定的遗传性能，即在品系、品种自群繁殖时，能将其特性稳定地传给后代。换言之，就是一个品系、品种必须具有一定的育种价值。
(四)具有共同遗传来源和一定的遗传结构：任何品系品种都可追溯到其共同的祖先,并由此分支经选育而成，其遗传结构也应是独特的。例如KM小鼠Glo-1位点为a基因单一型，而NIH小鼠在该基因呈多态分布，a、b型基因频率分别为67%和33%。如果将上述两个品种建立基因概貌就发现它们在基因概貌上的差异，而品种内这种差异是有限的。