鞭毛虫纲Flagellata 原生动物门质走（虫）亚门的一纲，与肉足虫纲一起共称为鞭毛肉足虫类（Sarcomastigophora）。最主要的特征是有一条至数条鞭毛作为细胞运动的细胞器。除这些终生具有鞭毛的以外。还有的是在发生初期产生，有的还在一生出现两次。体外层的外表面分化为结实的角薄膜或壳，但也有的可暂时形成伪足以及变形现象。有的为具有绿、黄、褐、红褐色等颜色的色素体，进行同化二氧化碳的无机营养型，有的为营有机营养型（包括腐生和寄生）。有的鞭毛虫在其失去鞭毛进入包囊状态而进行旺盛的分裂生殖的不定形群体期（palmella stage， palmelloid stage）时，则具有明显的植物性质。无大小两核的分化，排泄器官为收缩胞，进行纵分裂或拟横向分裂。有不少构成为群体（真群体及假群体）。有的在海水或淡水中营自由生活，有的寄生在其他动物的消化器官或血液内。由于有色素体的也可当作植物进行分类，所以在原生动物分类表中列出了二者的对应关系，有色素体的称植鞭虫类，无色素体的称动鞭虫类。