脊椎动物的部分卵裂的胚胎和哺乳类的胚胎，随着胚体境界沟从胚外区缢缩，前肠与后肠完成下壁而形成管状，这个管状部向内的开口称为肠门，且分别称为前肠门、后肠门。两肠门间开始时不形成下壁，前后成沟状称肠沟（intestinal groove），以后下壁渐渐地形成，肠管只在中肠部分以细的卵黄囊柄与卵黄囊相连。