亦称同型接合体。就所研究的若干基因而言，其具有相对关系的全部基因在机能和位点上都相同的接合体称为纯合子。一对相对基因有AA和aa两种基因型的个体，二对相对基因则有AABB，AAbb，aaBB，aabb四种基因型的个体。这种状态称为同型。原则上纯合子不会由于自交而分离出具有不同遗传因子的个体，因而可以用这种方法加以确定。全部基因都是同型的个体为纯系，通过反复自交或同系交配进行选择，可以得到纯合子。