类型I已知基因的序列
（1）已知DNA序列，包括三种情况，一是已知目的基因的DNA全部或部分DNA序列（与题目要求略有出入）；二是已知其它物种的同类基因的DNA序列（功能可能已知，与题目要求略有出入）；三是已知目的基因cDNA全部或部分序列（属于题目要求已达到的类型）。
（2）已知目的基因表达产物蛋白等序列。
在这两种情况下一般采用PCR技术或探针分子杂交技术分离克隆目的基因。
类型II已有基因图位或标记，转座子等条件，分别可采用转座子标签法、T-DNA标签法及图位克隆技术进行分离克隆目的基因。
类型III为止目的基因序列
（1）差异表达序列，即目的基因表达具有组织、器官等时空差异性。可以采用随机引物多态性扩增技术，定向引物扩增技术和DDRT-PCR、SSH-PCR、RAP-PCR、DNA-RDA、cDNA捕捉法等进行克隆。
（2）无差异表达的目的基因，可采用文库筛选法、功能蛋白分离法即直接测须发等进行，是难度较大较繁琐的策略。
从基因分离克隆的方法进行分类可分为三类：一种类型是功能克隆，即根据已知基因的产物推断出其相应核苷酸序列，再根据此序列合成寡聚核苷酸探针。从cDNA文库或基因组文库中调取目的基因。第二种类型是表型克隆。是近年来发展十分迅速的一类方法，例如差异筛选法、差减杂交（SH）、mRNA差别显示技术（DDRT-PCR）、代表性差异分析（RAD）抑制型差减杂交（SSH）等。第三类是无基因序列及表达功能信息，但具有基因遗传图，转座子标签等条件，常用图位克隆和转座子标签法克隆。
