定位克隆首先是获取基因在染色体上的位置的信息，然后采用各种实验方法克隆基因和进行定位。基因的定位克隆策略大体上可以分成四个步骤。①通过家系连锁分析资料或染色体微小缺失(杂合性丢失，LOH)等数据，确定基因在染色体上的位置；②通过染色体步移(chromosome walking)、染色体区带显微切割等技术，获得基因所在区段的DNA片段叠连群(contig)，绘制出更精细的染色体图谱；③确定含有候选基因的染色体片段；④从这些片段中进一步筛选目的基因，并作突变检测验证和功能分析。