组成相同而分子中的各种原子结合方式或顺序不同，因此有不同的官能团，这些化合物叫类别异构（叫官能团异构）。这一现象叫做类别异构现象。类别异构涉及分子中碳原子的结合方式（单键、双键或三键）、碳架的基本结构（成链或成环）以及其他原子在碳链中或碳链上的位置。这类异构如1，3-丁二烯和1-丁炔，环丁烷和1-丁烯，乙醇和甲醚，丙酮和丙醛。类别异构跟碳架异构、位置异构有很大的不同，类别异构体之间在化学性质上往往有本质上的差别。例如，组成相同的醇和醚属于类别异构，它们是化学性质完全不同的两类物质。