生化柴油（Biodiesel），又称脂肪酸甲酯（Fatty Acid Ester）是以植物果实、种子、植物导管乳汁或动物脂肪油、废弃的食用油等作原料，与醇类（甲醇、乙醇）经交酯化反应（Transesterification reaction）获得。生物柴油具有许多优点：①原料来源广泛，可利用各种动、植物油作原料。②生物柴油作为柴油代用品使用时柴油机不需作任何改动或更换零件。③可得到经济价值较高的副产品甘（Glycerine）以供化工品、医药品等市场。④相对于石化柴油，生物柴油贮存、运输和使用都很安全（不腐蚀溶器，非易燃易爆）；热值高（一般可达石化燃料油的80%）：可再生性（一年生的能源作物可连年种植收获，多年生的木本植物可一年种维持数十年的经济利用期入现实效益高；可在自然状况下实现生物降解，减少对人类生存环境的污染。生化柴油因其甲酯的运用性质与石化柴油类同，目前最常用的制取方法是将植物油脂与甲醇予以交酯化反应，并使用氢氧化钠（对油脂重量的1%）或甲醇钠（Sodium methoxide）做为触媒，大约混合搅拌反应2小时，即可制得。由于原料不同，生物柴油的生产工艺和标准亦不一样。