(1)老窖消毒：在马铃薯产区修建一个马铃薯窖，可用许多年。烂薯、病菌常会残存在窖内，新的薯块入窖初期往往温度较高，湿度又大，堆放新薯过程中一旦把病菌带到薯块上就会发病、腐烂，甚至造成“烂窖”。所以新薯入窖前应把老窖打扫干净，并用来苏儿喷一遍消毒灭菌，而后贮藏新薯。
　　(2)严格选薯；入窖时严格剔除病、伤和虫咬的块茎，防止入窖后发病。
　　(3)控制堆高：窖内堆放薯块的高度，因品种和窖的条件而不同。地下或半地下窖堆放时，不耐藏的、易发芽的品种堆高为0.5～l米；耐贮藏、休眠期中等的品种堆高1.5～2米；耐贮藏、休眠期长的品种堆高2～3米．但最高不宜超过3米。
    同时还要考虑贮藏窖的容积，贮藏量不能超过全窖容积的2／3，最好为1／2左右，以便管理。沟藏时薯堆高度以l米左右为宜。
　　(4)控制温、湿度；贮藏初期因薯块刚入窖，窖温和湿度可能高一些，这是正常现象，但一般不会超过20℃，20天后窖温下降。长期贮藏的块茎，温度在2～4℃之间最合适，这样块茎不会发芽。湿度维持在85％～90％为宜，可使块茎不致抽缩，保持新鲜状态。
　　(5)通风换气：不论固定窖或是沟藏，都必须有通风换气设备。把马铃薯呼吸排出的二氧化碳及时排出，使新鲜空气进入薯堆，以保持块茎的正常生理活动．窖内二氧化碳过多不仅对人进窖检查时不安全，而且会影响种薯的发芽率。
　　(6)覆盖散湿：块茎入窖后，在窖温降低时应在薯堆顶部覆盖一层干草或旧麻袋片等，使之吸湿，散发水分，固块茎贮藏期间堆内块茎呼吸散发的水分常凝结在上层块茎上，即所谓出汗。加覆盖物吸湿散发水分，可防止上层块茎霉烂。