一类形体微小、结构比较简单、一般要借助于显微镜或电子显微镜才能观察到的一大类微小生物的总称。包括细菌、放线菌、霉菌、酵母菌、原生动物、单细胞藻类、病毒以及立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体等。微生物广泛分布于自然界，与人类生存密切相关。土壤微生物是肥力的重要因素，并在自然界碳、氮、硫、磷等多种物质的循环中起着重要作用。微生物数量大、繁殖快、代谢及生理类型繁多、易人工培养，已被广泛应用于工农业生产。例如，除生产菌肥、发酵饲料、抗生素、菌苗、疫苗等农医产品外，还可生产有机酸、有机溶剂、酶制剂、氨基酸等大量工业产品。无论在食品、酿造、石油、冶金、纺织等工业以及环境保护各方面，均具有重要作用。微生物又是生命科学及生物工程研究的重要组成部分。在研究生命本质、生命活动规律及遗传进化等方面具有重要研究价值。但有不少微生物能引起人类及动植物病害。