富营养化主要是指向水体中投入或排入生物所需的氮、磷等营养物质。如农田灌溉水和含有化肥的农用水；工业废水和生活污水等。水体富营养化后，在水面上往往出现由藻类形成的一片片“水华”，在近海地区叫“赤潮”。在发生赤潮的水域里，一些浮游生物暴发性繁殖，使水变成红色，因此叫“赤潮”。这些藻类有恶臭、有毒，鱼不能食用。藻类遮蔽阳光，使水底生植物因光合作用受到阻碍而死去，腐败后放出氮、磷等植物的营养物质，再供藻类利用。这样年深月久，造成恶性循环，藻类大量繁殖，水质恶化而有腥臭，造成鱼类死亡。