基因网络系统是鲍文奎先生提出的，该系统认为，不同的生物其基因组都有一套保证个体正常生长与发育的遗传信息，包括全部的编码基因，控制基因表达的控制序列，以及协调不同基因之间相互作用的组分。基因组将这些看不见的信息编码在DNA上，组成了一个使基因有序表达的网络，通过遗传程序将各种基因的活动联系在一起，如果某些基因发生了突变，则会影响到网络中的其他成员，并通过网络系统进 一步扩大其影响，进一步发展成为可见变异。该系统还认为，在不同物种，不同生态型到同一生态型的不同个体之间存在许多执行同一功能的基因，它们在基因网络系统中处在相同的工作位置，但其功能或工作效率会有稍微的差别。在一个杂合的基因型中，就某个指定的基因而言，只要一个稍次的等位基因成员的表达代替最佳成员，就可能影响网络系统的网络系统的工作效率，杂种一代是两个不同基因群组合在一起形成一个新的网络系统，在这个新组建的网络系统中，等位基因成员处在最好的工作状态，使整个遗传体系发挥最佳效率时，即可实现杂种优势。