丹麦植物遗传学家约翰森（W.L.Johannsen，1857～1927）根据菜豆选种试验结果于1909年提出来的一种学说。认为植物连续自交若干代后，能形成基因型纯合的品系，即纯系。由于环境的影响，纯系中各个个体在一些数量性状（如豆粒的重量）会出现变异，但对这种变异进行选择是没有意义的，因为它们的后代仍会在纯系的范围内发生变异，这就是他提出的所谓纯系内选择无效的观点。纯系内个体差异由环境影响造成，是不遗传的，故纯系内选择无效。纯系学说区分了遗传的变异和不遗传的变异，指出在纯系内对由环境影响造成的变异进行选择是无效的。长期以来它是自花授粉作物单株选择育种的理论根据。但他所指的纯系，仅就菜豆粒重这一性状而言，并未涉及所有性状；何况“纯”只是相对的，所谓纯系在日益扩大繁殖的情况下，由于天然杂交和突变，必然会发生基因的分离和重组。育种实践表明，在“纯系”内进行选择也不是完全无效的。他把纯系学说与达尔文进化论联系起来，认为选择只能对现成的遗传差异起分类和过筛的作用，并不能创造新种。这样的看法现在看来也是站不住脚的。