又称遗传型。某一生物个体全部基因组合的总称。在杂交试验中，专指所研究的、与分离现象有关的基因组合，如纯种高茎豌豆（DD）、杂种高茎豌豆（Dd）等。基因型一般不能直接看到，需要通过杂交（测交）试验从表现型来推知。显性不完全时，基因型与表现型一致，例如，表现型为透明金鱼、普通金鱼和五花鱼的金鱼，它们的基因型分别是TT、Tt、和tt；显性完全时，基因型与表现型不一致，例如，纯种高茎豌豆的基因型是DD，杂种高茎豌豆的基因型是Dd。在这种情况下，必须通过测交试验，根据后代的表现，才能推知高茎豌豆的基因型是DD还是Dd。以高茎豌豆与纯种矮茎豌豆杂交，如果测交后代都是高茎豌豆，便可推知它的亲本的基因型是DD；反之如果测交后代中高茎和矮茎各占一半，那就证明它的亲本的基因型是Dd。